Si siempre quisiste convertirte en un caballero Jedi esta es tu ocasión, pues Jedi Academy te pondrá en la piel de un alumno de la academia en que Luke Skywalker entrena a los nuevos portadores de la fuerza con ayuda de su compañero Kyle Katarn, protagonista de las anteriores entregas de Jedi Knight.
Durante tu entrenamiento unos personajes desconocidos aparecen en la academia y absorben la fuerza del lugar: los Sith, archienemigos de los Jedis. Luke inicia una investigación con la ayuda de todos los alumnos y profesores de la escuela, que se dedicarán a recorrer el universo intentando esclarecer los hechos y descubrir de que andan detrás los guerreros Sith. Ahí es donde tú, como aprendiz, deberás elegir diferentes misiones con objetivos tan variados como rescatar a unos comerciantes que se han estrellado en un peligroso planeta, investigar unas instalaciones de lo que queda del Imperio o perseguir a delincuentes y caza-recompensas. La experiencia que irás ganando mientras cumples las misiones te permitirá avanzar en el camino de la fuerza, obteniendo nuevos poderes y habilidades, así como distintos estilos de lucha, y convirtiéndote finalmente en un Caballero Jedi en toda regla.
Al contrario de lo que ocurría con Jedi Knight II, en esta ocasión el argumento no es lineal y podemos elegir el orden en que queremos cumplir las misiones. En determinadas ocasiones se nos da la oportunidad de tomar decisiones importantes, como cambiar el clásico sable láser por dos más ligeros o uno de doble filo parecido al que usaba Darth Maul o incluso ejecutar a sangre fría a un enemigo convirtiéndonos así al lado oscuro y cambiando totalmente el rumbo del argumento.
Jedi Academy reúne lo mejor de Jedi Outcast y lo evoluciona hacia unas características más agradables para los aficionados a la saga Star Wars. Ejemplo de ello es la importancia que se ha dado en esta ocasión al sable láser y a las luchas cuerpo a cuerpo entre guerreros Jedi y Sith, dejando muy de lado las armas de energía y de proyectiles, algo que sin duda agradecerán los seguidores.